L'Initiative est dirigée par l'Institut Bill & Melinda Gates pour la population et la santé génésique au sein du département de l'École de santé publique Johns Hopkins Bloomberg.

Les centres d'accélération régionaux de l'Initiative sont dirigés par des partenaires d'exécution avec des équipes techniques d'experts en santé de la reproduction en milieu urbain qui peuvent être élargies à mesure que d'autres pays y participent.